MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 2314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014299	CGG	2	6	37	42	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014299	ATCT	2	8	85	92	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014299	TGG	2	6	195	200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014299	AAT	2	6	355	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014299	GTC	2	6	380	385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014299	TCA	2	6	440	445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014299	CCT	2	6	938	943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014299	ATCC	2	8	1004	1011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014299	CGA	2	6	1110	1115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014299	AAG	2	6	1134	1139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014299	CT	3	6	1141	1146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014299	TA	3	6	1186	1191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014299	ATAG	2	8	1210	1217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014299	CATA	2	8	1218	1225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014299	AAT	2	6	1233	1238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014299	AG	3	6	1304	1309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014299	ATG	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014299	A	6	6	1443	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014299	AT	3	6	1492	1497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014299	CCT	2	6	2026	2031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014299	AGC	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014299	TCC	2	6	2044	2049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014299	ATT	2	6	2080	2085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014299	CGC	2	6	2091	2096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014299	AAT	2	6	2169	2174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014299	AGT	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014299	AG	3	6	3544	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014299	GA	3	6	3557	3562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014299	TCG	2	6	3727	3732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014299	TAT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014299	TTA	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014299	CGCC	2	8	4677	4684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014299	GAC	2	6	4845	4850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014299	GAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014299	AAC	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014299	GGC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014299	CGA	2	6	5677	5682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014299	AAC	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014299	AGT	3	9	5756	5764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014299	TAG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014299	CAC	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014299	AGAC	2	8	5830	5837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014299	CTT	2	6	5856	5861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014299	TTC	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014299	GTC	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014299	ATG	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014299	GAC	2	6	13298	13303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014299	AAG	2	6	13342	13347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014299	AGTC	2	8	13354	13361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014299	GTT	2	6	13377	13382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014299	AGTT	2	8	13400	13407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014299	CGA	2	6	13520	13525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014299	AG	3	6	13549	13554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014299	ACA	2	6	13586	13591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014299	GAA	3	9	13624	13632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014299	GAAT	2	8	13646	13653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014299	TAC	2	6	13659	13664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014299	CGA	2	6	13674	13679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014299	CTG	2	6	13703	13708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014299	GAC	2	6	13720	13725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014299	GAA	2	6	13771	13776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014299	AGG	2	6	13794	13799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014299	TCG	2	6	14003	14008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014299	CTGGT	2	10	14020	14029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014299	CGCGT	2	10	14055	14064	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014299	CTC	2	6	14094	14099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014299	GCT	2	6	14618	14623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014299	TGG	2	6	14637	14642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014299	ATA	2	6	14646	14651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014299	TGC	2	6	14714	14719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014299	GAT	2	6	14755	14760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014299	TGA	2	6	15356	15361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014299	TCTA	2	8	15399	15406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014299	TACT	2	8	15407	15414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014299	TGTA	2	8	15456	15463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014299	TCCA	2	8	15684	15691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014299	TGT	2	6	15695	15700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014299	CGA	2	6	15722	15727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014299	TGG	2	6	15831	15836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014299	GCC	2	6	15838	15843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014299	TAC	2	6	15850	15855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014299	TGG	3	9	16518	16526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014299	GCAC	2	8	16727	16734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014299	TGA	2	6	16831	16836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014299	GTC	2	6	16870	16875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014299	TTGA	2	8	18139	18146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014299	GA	3	6	18156	18161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014299	CTT	2	6	18173	18178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014299	TCTAGA	2	12	18184	18195	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014299	GATCTA	3	18	18201	18218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014299	CTA	8	24	18221	18244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014299	ACA	5	15	18249	18263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014299	GTT	2	6	18288	18293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014299	GGT	2	6	18335	18340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014299	TCATAT	2	12	18413	18424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014299	AGT	2	6	18494	18499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014299	GGGT	2	8	18551	18558	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014299	GTTT	2	8	18567	18574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014299	ATG	2	6	18600	18605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014299	CG	3	6	18619	18624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014299	GTC	2	6	18693	18698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014299	TGG	2	6	18733	18738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014299	CCG	2	6	18789	18794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014299	GGA	2	6	18799	18804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014299	GCC	2	6	18813	18818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014299	AGG	2	6	18834	18839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014299	GC	3	6	18852	18857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014299	CGG	2	6	18891	18896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014299	GGT	2	6	18907	18912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014299	CAC	2	6	18915	18920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014299	CGA	2	6	19030	19035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014299	CTC	2	6	21086	21091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014299	CTT	2	6	21131	21136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014299	ATA	2	6	21167	21172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014299	CTT	2	6	21185	21190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014299	CCT	2	6	21256	21261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014299	GT	3	6	21298	21303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014299	TTTG	2	8	21327	21334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014299	TTC	2	6	21356	21361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014299	AGT	2	6	21445	21450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014299	TCGG	2	8	21565	21572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014299	GAG	2	6	21578	21583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014299	CGA	2	6	21600	21605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014299	CCG	2	6	21606	21611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014299	ATC	2	6	22060	22065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014299	ATA	2	6	22079	22084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014299	ACC	2	6	22138	22143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014299	GGC	2	6	22177	22182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014299	GGT	2	6	22189	22194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014299	CA	3	6	26701	26706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014299	TGG	2	6	26817	26822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014299	GC	3	6	26853	26858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014299	GCGGT	2	10	26878	26887	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014299	CT	3	6	26915	26920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014299	AAC	2	6	26979	26984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014299	GCA	2	6	27015	27020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014299	TCC	2	6	27052	27057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014299	CTG	2	6	27061	27066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014299	AGC	2	6	27102	27107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014299	AAAT	2	8	27254	27261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014299	GCT	2	6	27312	27317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014299	CT	3	6	27416	27421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014299	CGT	2	6	27494	27499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014299	CAA	2	6	27520	27525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014299	GCG	2	6	27615	27620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014299	TAC	2	6	27629	27634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014299	GT	3	6	27675	27680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014299	CGG	2	6	27716	27721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014299	CGA	2	6	27817	27822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014299	GCGA	2	8	27831	27838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014299	GAC	2	6	27881	27886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014299	CGAG	3	12	27892	27903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_014299	GTGA	2	8	27959	27966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014299	AC	3	6	28050	28055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014299	GGA	2	6	28132	28137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014299	CAG	2	6	28711	28716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014299	TTCA	2	8	28768	28775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_014299	CAA	2	6	28803	28808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014299	AGG	2	6	28823	28828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014299	TC	3	6	29051	29056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_014299	CCA	2	6	29064	29069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_014299	CCGCC	2	10	29082	29091	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
163	NC_014299	TGG	2	6	30162	30167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014299	CTT	2	6	30176	30181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_014299	CGC	2	6	30220	30225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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169	NC_014299	GAG	2	6	32139	32144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014299	GAA	2	6	32196	32201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014299	CAA	2	6	32225	32230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_014299	CTT	2	6	32253	32258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_014299	GAT	2	6	32295	32300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014299	GT	4	8	32367	32374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_014299	GTG	2	6	33105	33110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014299	TTC	2	6	33136	33141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_014299	AGC	2	6	33288	33293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_014299	TGG	2	6	35093	35098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_014299	GTTG	2	8	35201	35208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014299	TGAA	2	8	35926	35933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014299	AAT	2	6	35943	35948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_014299	ATTC	2	8	35983	35990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
191	NC_014299	GTGTC	2	10	37522	37531	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_014299	TGG	2	6	39402	39407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014299	GGT	2	6	39420	39425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_014299	TTGAG	2	10	52779	52788	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_014299	ATGT	2	8	95309	95316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_014299	AT	3	6	96718	96723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_014299	AG	3	6	98821	98826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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